A Área de Estudo II (AE–II) é composta pelos setores: 

▪ Logística e Mobilização; 

▪ Administração e Processos de Tomada de Decisão; 

▪ Economia e Finanças; e 

▪ Comunição Social e Liderança 

A AE-II desenvolve o ensino e a pesquisa acadêmica dos assuntos, cujos títulos dão nome aos respectivos setores (logística e mobilização; administração e métodos de tomada de decisão; e economia). Também desenvolve as disciplinas correlatas a estes assuntos, bem como as atinentes ao Serviço de Intendência nos quatro cursos do Ensino Profissional Naval e nos cursos de pós-graduação lato sensu tipo Master of Business Administration (MBA), do Instituto de Administração da Universidade Federal do Rio de Janeiro (COPPEAD/UFRJ), ministrados pela EGN. 

A AE-II contribui, ainda, para a elaboração das provas do exame de seleção ao Curso de Estado-Maior para Oficiais Superiores (C-EMOS) e para a confecção das orientações necessárias ao desenvolvimento dos temas de interesse de Alta Administração Naval no Curso de Política e Estratégia Marítimas (C-PEM).